Dans une situation de surabondance des Centres de recherches nationaux, Jules Guéron s'appliqua à ce que la création du Centre commun de recherches ne vienne pas aggraver ce surplus. Il préconisa donc d'"européaniser" des centres nationaux. Au Centre allemand de Karlsruhe est construit en 1961 l'Institut européen des Transuraniens. En juin 1961 une Convention entre le Gouvernement belge et la Commission d'EURATOM crée le Bureau central de mesures nucléaires à Geel. En 1962 le Centre néerlandais de Petten, où est construit un réacteur à haut flux, devient établissement du Centre commun.