Il CIFE svolge attività speciali di collaborazione con il Ministero degli Affari Esteri, con il Ministro della Pubblica Istruzione, con altre Amministrazioni dello Stato e degli Enti regionale e locali, con la Commissione Europea, nonchè con altre istituzioni e centri di ricerca e con le principali associazioni europee e federaliste: Associazione Italiana per il Consiglio dei Comuni e delle Regioni d'Europa (AICCRE); Associazione Europea degli Insegnanti (AEDE), Consiglio Italiano de Movimento Europeo (CIME); ed in particolare con il Movimento Federalista Europeo (MFE) e la Gioventù Federalista Europea (GFE).
Dal 1989 il CIFE ha predisposto un programma di attività specialmente riservato agli studenti italiani ed euroei coinvolti nei programmi comunitari ad esempio Leader; iniziative prese in collaborazione con diverse sedi universitarie (Pavia, Ancoran, Pescara, Viterbo, Palermo ed altre).

Au printemps 1970 fut décidé à Nice la création de l'Association des anciens élèves de Nice et d'Aoste. En 1993, le directeur du CIFE a décidé de revitaliser cette initiative et l'a appelé l'Association des Anciens du CIFE et de l'Institut européen des hautes études internationales (IEHI)