Giangaleazzo Cairoli entre à la Commission européenne en 1967, d'abord à la DG IX (Administration du personnel, service "Recrutement et carrières"), puis, à partir de 1982, à la Task Force pour les Technologies de l'Information, devenue ensuite la DG XIII.
Dans ce contexte, il entretint une collaboration étroite avec le Directeur Général Michel Carpentier pour la mise en place des structures administratives de la nouvelle DG et au lancement du programme ESPRIT (European Research Program on Information Technologies). Il fut par la suite chargé des aspects administratifs de la gestion du programme de recherche sur les applications télématiques (TAP). Il collabora également avec la DG Regio pour la promotion de la Société de l'Information dans les Régions européennes. Il quitta la Commission en 2004.