Jean-Claude Séché étudie le droit dans les facultés de Caen et Paris. Il fait ensuite une thèse de doctorat en Allemagne, en passant par Mayence et Cologne, sur la responsabilité de l'Etat en droit allemand (1958).
Il débute sa carrière comme chargé de cours à la faculté de droit à Clermont-Ferrand (1961-1965) puis comme maître-assistant à Paris. Il enseigne le droit public, notamment le droit communautaire.
En 1965, il entre à la Commission CEE comme conseiller juridique au Service juridique et s'occupe plus particulièrement de la sécurité sociale des migrants. Au Service juridique il s'occupe en 1965 de la circulation des travailleurs, politique sociale, Fonds social européen.
En 1968 il devient assistant du Directeur général. Successivement il traite des affaires économiques et monétaires, assurances et banques ; valeurs mobilières et bourses ; harmonisation des législations en 1978, de l'agriculture en 1980, de la codification du droit communautaire en 1986, de la cohésion économique et sociale, en 1988.
Il est ensuite en 1991 responsable de l'équipe « Droits sociaux, politiques des personnes, coopérations policière et judiciaire ».
Entre 1979 et 1997, date de sa retraite, Jean-Claude Séché est aussi professeur à l'Institut d'études européennes de l'Université libre de Bruxelles où il enseigne les questions relatives à la libre circulation des personnes, des services et des capitaux.
En outre il est membre de la commission de l'Union européenne du Conseil supérieur des Français de l'étranger, vice-président des "Européens dans le Monde".