François Fontaine fait ses études à la faculté de droit de Bordeaux puis de Paris où il achève sa licence puis obtient le diplôme de l’Ecole des sciences politiques (1940). Il travaille ensuite à l’agence de presse Havas et, après la guerre, au magazine «Carrefour». Après cette expérience journalistique, il entre au service de presse et d’information du ministère des Affaires étrangères puis au commissariat général du Plan, aux côtés de Jean Monnet, où il s’occupe des rapports avec la presse. Après la création de la Haute autorité du charbon et de l’acier à Luxembourg, en 1952, il devient le chef de cabinet du président Jean Monnet. Plus tard, François Fontaine dirige le Bureau d’information de la Commission européenne à Paris. Intime de Jean Monnet, il joue également un rôle actif dans la rédaction des « Mémoires » de ce dernier (Fayard, 1976).