Après des études à la faculté des Lettres de la Sorbonne puis à l'Ecole libre des Sciences politiques, Jean-Marc Boegner devient successivement attaché d'ambassade (1939), conseiller d'ambassade (1945) et ministre plénipotentiaire (1954). En 1955 il est directeur de cabinet de Gaston Palewski, ministre délégué à la Présidence du Conseil, chargé des Questions atomiques, dans le ministère Edgard Faure. Il est ensuite conseiller technique d'abord au cabinet de Charles de Gaulle, président du Conseil, en 1958 puis au secrétariat général de la Présidence de la République en 1959. En novembre 1959, il est nommé ambassadeur en Tunisie. De 1961 à 1972, il est le représentant permanent de la France auprès des Communautés européennes à Bruxelles. Il est élevé à la dignité d'ambassadeur de France en 1973. Il siège de 1975 à 1978 à l'OCDE en qualité de représentant permanent de la France. De 1986 à 1987, il est conseiller auprès de Jacques Chirac, Premier ministre. L'ambassadeur Boegner est décédé le 24/01/2003.
Publications: Le Marché commun de Six à Neuf, Paris, Colin, 1974. Nombreux articles notamment dans la revue Espoir.