Le Secrétariat général assure l'organisation fonctionnelle du CCE, il coordonne les activités des Sections nationales et constitute le lien entre les organes dirigeants et les membres. Jusqu'en 1955, il exista deux sièges du Secrétariat international: Le premier était installé à Genève à la 'Maison des Communes d'Europe' sous la direction de Mme de Jager et Milan Bodi, le deuxième se trouvait à Paris. Ici, l'administrateur principal était Jean Bareth, Maire adjoint de Boulogne-Billancourt et fédéraliste de la première heure. Il porta divers titres (Secétaire du CCE, délégué général du CCE), à partir de 1953 il signa 'le Secrétaire général du CCE'. En 1955 le siège de Genève fut dissout. Après la mort de Jean Bareth en 1969, ce dernier fut remplacé d'abord par Thomas Philippovich et ensuite par Elisabeth Gateau. Actuellement la fonction est assurée par Jeremy Smith.
La série et ses deux sous-séries recueillent correspondance, notes, rapports, compte-rendus de réunions et coupures de presse reçus et expédiés par le Secrétariat général.