Les Conseils nationaux du Mouvement européen ont pour mission de faire connaitre les buts, le programme, les résolutions et recommandations du mouvement qu'en tant que membres de celui-ci, ils contribuent à faire adopter. Ils adaptent le programme général du mouvement aux conditions nationales, prennent les résolutions concernant tant l'application de celui-ci que leur vie propre et arrêtent les recommandations que les circonstances nationales justifient. Sous l'influence de 'l'unioniste' Duncan Sandys, ont été constitués des Conseils nationaux chargés de représenter le mouvement dans la plupart des pays libres d'Europe. Ce qui eut pour conséquence d'atténuer l'influence directe des organisations internationales militantes.